Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms