Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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