Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde12Q3TIU4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms