Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Treml4Q3LRV9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Treml4Q3LRV9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Treml4Q3LRV9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Treml4Q3LRV9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Treml4Q3LRV9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Treml4Q3LRV9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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