Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms