Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms