Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ttc39dQ0VF76 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ttc39dQ0VF76 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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