Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col19a1Q0VF58 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col19a1Q0VF58 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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