Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms