Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Neurl1bQ0MW30 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Neurl1bQ0MW30 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms