Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms