Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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