Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms