Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms