Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms