Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms