Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms