Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja5Q01231 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja5Q01231 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja5Q01231 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Gja5Q01231 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gja5Q01231 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms