Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms