Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme1P97371 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme1P97371 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms