Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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