Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms