Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gnb1P62874 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms