Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SmoP56726 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SmoP56726 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SmoP56726 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms