Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sh3bp1P55194 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sh3bp1P55194 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sh3bp1P55194 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Sh3bp1P55194 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Sh3bp1P55194 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Sh3bp1P55194 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Sh3bp1P55194 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Sh3bp1P55194 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Sh3bp1P55194 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Sh3bp1P55194 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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