Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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