Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc3P49135 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc3P49135 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms