Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms