Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms