Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Elk1P41969 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Elk1P41969 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Elk1P41969 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Elk1P41969 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Elk1P41969 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Elk1P41969 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms