Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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