Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtlP38585 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtlP38585 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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