Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Upk2P38575 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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