Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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