Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PparaP23204 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PparaP23204 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PparaP23204 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PparaP23204 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms