Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms