Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms