Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18526 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18526 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18526 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms