Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms