Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl2P10148 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms