Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PtprqP0C5E4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PtprqP0C5E4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PtprqP0C5E4 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PtprqP0C5E4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PtprqP0C5E4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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PtprqP0C5E4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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PtprqP0C5E4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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PtprqP0C5E4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprqP0C5E4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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