Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxa6P09092 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms