Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Hoxd3P09027 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Hoxd3P09027 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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