Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms