Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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H2-Ab1P01921 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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H2-Ab1P01921 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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H2-Ab1P01921 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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