Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01735 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01735 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01735 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01735 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01735 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01735 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01735 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01735 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01735 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01735 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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