Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops6O88545 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops6O88545 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops6O88545 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cops6O88545 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cops6O88545 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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