Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms