Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm21411J3KMS0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21411J3KMS0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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