Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnmal2G3X9N3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnmal2G3X9N3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1761.8 ms